Согласно министерству предоставленный «Казаками Гагаузии» устав противоречит Конституции Молдовы. Сотрудники министерства ознакомились с учредительными документами «Казачества Гагаузии» и с деятельностью подобных организаций в Левобережье Молдовы, а также за границей и пришли к выводу, что создаваемая организация будет подобной уже существующим аналогам.

По мнению Министерства юстиции, казачество известно своими вооруженными объединениями, в том числе как те которые участвовали в конфликте 1992 на Днестре, в качестве иностранных агрессоров, что было осуждено Европейским судом по правам человека.

Помимо этого организация подала не полный пакет документов. Также в документах содержались ошибки, в частности были вписаны пункты о коммерческой деятельности, что не совместимо со статусом общественной организации.